Встановлюємо gconf-editor. Запускаємо його і йдемо за таким шляхом /desktop/gnome/applications/component_viewer/exec. І дивимося чи ключ exec має значення nautilus %s.

Спочатку варто спробувати команду

$ xdg-mime default nautilus.desktop inode/directory

а потім, для перевірки, виконати команду

xdg-open ~/

Якщо ж не спрацює, то тоді відкриваємо в текстовому редакторі файл ~/.local/share/applications/mimeapps.list. Слід знайти рядок inode/directory і після знаку дорівнює вписати nautilus.desktop.

Використані матеріали:

GNOME3 How to set the default file manager?

Default appications. Arch wiki

GNOME. Miscellaneous_settings. Arch wiki

Setting Default Applications in gnome 3 (Arch forum)

[Solved] Change preferred applications in gnome-shell (Arch forum)